政府在食品安全體系建設(shè)與運行中扮演重要角色，但是，農(nóng)產(chǎn)品食品安全工作僅僅靠政府是遠(yuǎn)遠(yuǎn)不夠的。在歐美等發(fā)達(dá)國家，通過第三方認(rèn)證機構(gòu)的認(rèn)證活動來加強農(nóng)產(chǎn)品、食品生產(chǎn)和經(jīng)營企業(yè)安全體系的建設(shè)已經(jīng)成為保障食品安全的重要手段，同時也降低了行政成本，有利于分散行政風(fēng)險。
我國《農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量安全法》已經(jīng)于2006年11月1日實行，為保障農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量安全，維護(hù)公眾健康，促進(jìn)農(nóng)業(yè)和農(nóng)村經(jīng)濟(jì)發(fā)展提供了法律保證?！掇r(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量安全法》在第8條和第9條中，明確指出國家引導(dǎo)、推廣標(biāo)準(zhǔn)化生產(chǎn)，鼓勵和支持生產(chǎn)優(yōu)質(zhì)農(nóng)產(chǎn)品，推行科學(xué)的質(zhì)量管理辦法。
認(rèn)證是當(dāng)前國際通行的農(nóng)產(chǎn)品和食品質(zhì)量安全管理手段，其最具有特色且起著重要作用的功能在于：
一是有利于推進(jìn)標(biāo)準(zhǔn)化的貫徹實施，便于規(guī)范農(nóng)產(chǎn)品種養(yǎng)過程及食品加工、銷售等環(huán)節(jié)，促使農(nóng)產(chǎn)品及食品的生產(chǎn)者、經(jīng)營者及相關(guān)管理者樹立標(biāo)準(zhǔn)意識和質(zhì)量意識。
二是判定農(nóng)產(chǎn)品、食品是否符合標(biāo)準(zhǔn)，是由處于公正地位的專業(yè)化的認(rèn)證機構(gòu)作出的。它以不同于農(nóng)產(chǎn)品種植、養(yǎng)殖方和食品加工方（即第一方）與批發(fā)商、經(jīng)銷商（即第二方）的第三方身份，對獲得認(rèn)證的產(chǎn)品持續(xù)符合標(biāo)準(zhǔn)和技術(shù)規(guī)范的要求提供證明，并承擔(dān)保障認(rèn)證結(jié)果公正和有效的責(zé)任。
三是有利于解決當(dāng)前國際農(nóng)產(chǎn)品及食品貿(mào)易遇到的技術(shù)壁壘，通過農(nóng)產(chǎn)品、食品認(rèn)證的國際互認(rèn)，便于我國農(nóng)產(chǎn)品、食品順利走出國門。
四是開展認(rèn)證適應(yīng)了政府職能轉(zhuǎn)變和機構(gòu)改革形勢，有利于政府從直接實施產(chǎn)品質(zhì)量安全檢驗檢測等行政審批性質(zhì)（直接承擔(dān)著質(zhì)量安全的責(zé)任）的工作中解脫出來，減少政府的責(zé)任和風(fēng)險，因而對于深化行政管理體制改革，提高政府效能，從源頭上預(yù)防和治理腐敗，也具有重要意義。
目前，我國管理農(nóng)產(chǎn)品、食品質(zhì)量安全的方式方法有很多。專家建議，應(yīng)對我國農(nóng)產(chǎn)品認(rèn)證制度進(jìn)行整合，按照農(nóng)產(chǎn)品、食品生產(chǎn)供應(yīng)鏈建立我國農(nóng)產(chǎn)品和食品質(zhì)量安全認(rèn)證的框架。同時，實施現(xiàn)有的無公害農(nóng)產(chǎn)品、綠色食品、有機食品認(rèn)證制度，既滿足一般消費者對質(zhì)量安全的基本要求，又適應(yīng)不同消費層次比較高的要求。
